Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm3002E9PW72 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm3002E9PW72 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms