Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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