Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms