Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Grik3B1AS29 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Grik3B1AS29 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms