Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vstm4T1NXB5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms