Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hdac5Q9Z2V6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hdac5Q9Z2V6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms