Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac6Q9Z2V5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdac6Q9Z2V5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms