Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Crlf3Q9Z2L7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Crlf3Q9Z2L7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms