Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mbd1Q9Z2E2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd1Q9Z2E2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms