Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mbd3Q9Z2D8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mbd3Q9Z2D8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms