Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms