Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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Sh3bp5Q9Z131 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp5Q9Z131 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
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Sh3bp5Q9Z131 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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Sh3bp5Q9Z131 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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Sh3bp5Q9Z131 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Sh3bp5Q9Z131 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp5Q9Z131 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms