Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Skp2Q9Z0Z3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skp2Q9Z0Z3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms