Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup160Q9Z0W3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup160Q9Z0W3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms