Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SncgQ9Z0F7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SncgQ9Z0F7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms