Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms