Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tusc2Q9WVF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms