Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme3Q9WV85 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme3Q9WV85 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms