Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrf1Q9WU00 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrf1Q9WU00 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms