Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam50bQ9WTJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam50bQ9WTJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam50bQ9WTJ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms