Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tubd1Q9R1K7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubd1Q9R1K7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms