Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Taf7Q9R1C0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf7Q9R1C0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf7Q9R1C0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms