Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rfwd2Q9R1A8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rfwd2Q9R1A8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms