Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmed2Q9R0Q3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed2Q9R0Q3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms