Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf346Q9R0B7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf346Q9R0B7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms