Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gpc6Q9R087 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gpc6Q9R087 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gpc6Q9R087 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gpc6Q9R087 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gpc6Q9R087 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gpc6Q9R087 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc6Q9R087 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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