Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nubp2Q9R061 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nubp2Q9R061 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nubp2Q9R061 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nubp2Q9R061 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nubp2Q9R061 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nubp2Q9R061 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nubp2Q9R061 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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