Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bcl11aQ9QYE3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bcl11aQ9QYE3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms