Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp3Q9QY23 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms