Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Opn4Q9QXZ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn4Q9QXZ9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms