Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pcsk1nQ9QXV0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pcsk1nQ9QXV0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms