Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc5Q9QX29 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc5Q9QX29 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc5Q9QX29 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms