Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rai2Q9QVY8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rai2Q9QVY8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms