Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tcea2Q9QVN7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcea2Q9QVN7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms