Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dkk3Q9QUN9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dkk3Q9QUN9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms