Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cln8Q9QUK3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cln8Q9QUK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms