Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Csnk1eQ9JMK2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Csnk1eQ9JMK2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms