Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnaja4Q9JMC3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnaja4Q9JMC3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms