Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bace2Q9JL18 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace2Q9JL18 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms