Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scamp4Q9JKV5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scamp4Q9JKV5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms