Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chrac1Q9JKP8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chrac1Q9JKP8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms