Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl39Q9JKF7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl39Q9JKF7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms