Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scamp5Q9JKD3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scamp5Q9JKD3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms