Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ybx3Q9JKB3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ybx3Q9JKB3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms