Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Uchl3Q9JKB1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Uchl3Q9JKB1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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