Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Alyref2Q9JJW6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Alyref2Q9JJW6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms