Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra4Q9JJT2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra4Q9JJT2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra4Q9JJT2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra4Q9JJT2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra4Q9JJT2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra4Q9JJT2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gfra4Q9JJT2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfra4Q9JJT2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra4Q9JJT2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms