Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcl1Q9JJT0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcl1Q9JJT0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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