Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ascl3Q9JJR7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ascl3Q9JJR7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms