Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl1Q9JI74 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl1Q9JI74 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms